海军实力突出的文明包括葡萄牙、萨拉森、意大利、维京、拜占庭和马来，它们被广泛视为一流的海军强国。这些文明凭借独特的经济加成、特色战舰或完整的海军科技树，在海战地图上能够建立显著优势，但具体强弱也取决于地图类型和玩家的战术执行。
葡萄牙的海军以其出色的持久战和经济能力著称。该文明的所有单位消耗的黄金减少，同时战舰的生命值获得提升，这使得其海军部队在资源消耗和生存能力上占优。其特色单位卡拉维尔战舰具备弩炮般的穿刺攻击效果，能对密集的敌船造成可观的群体伤害。再配合其独特的经济建筑大商站的支持，葡萄牙海军在中后期海战中往往能占据上风。
萨拉森和意大利的海军则分别以强大的攻击力和快速的科技升级见长。萨拉森的箭船拥有极快的攻击速度，能在短时间内倾泻大量伤害，同时其运输船的生命值和运载量翻倍，在登陆作战和兵力调度上极为灵活。意大利的优势在于时代升级和海军科技研发的成本大幅降低，这使得它能够更早、更便宜地升级战舰和时代，从而在海军科技上领先对手，形成压制。
维京和拜占庭的海军分别依靠强大的经济后盾和专业的反制能力立足。维京文明拥有时代推进而递增的战舰费用减免，并且免费获得关键的经济科技，这使得其海军爆发的经济压力很小，可以持续不断地生产战舰。拜占庭的特色在于其强化的喷火船，不仅攻击速度加快，射程也因特色科技而增加，这使得它在对抗箭船等主力战舰时具有毁灭性的克制效果，且其海军科技树非常完整。
马来则是海上的快攻专家，其升级时代的速度远超其他文明，能更快进入强势期。它的养鱼场成本低廉且能提供无限食物，确保了海上经济的长久稳定。其特色建筑海上霸主巨港更是一个能射箭的坚固堡垒，攻防一体。这些文明共同构成了海战中的第一梯队，但具体选择还需考虑地图是否为纯海图或岛屿图。
