选择合适的忍者组合是取胜的关键。双人模式的核心在于队友之间的配合与忍者的技能互补，因此需要优先考虑忍者的控制能力、爆发输出以及生存能力。部分忍者由于技能范围广或连招稳定，在双人模式中表现尤为突出，例如具备远程消耗能力的忍者和拥有强力控制的忍者。
具备高爆发输出的忍者在双人模式中能快速压低对手血线，为队友创造收割机会。这类忍者通常拥有短冷却的高伤害技能，能在短时间内打出可观的伤害。部分忍者的奥义技能具备大范围或多段攻击效果，在双人混战中能发挥更大作用。若队友选择控制型忍者，则爆发型忍者能更安全地输出。
控制型忍者在双人模式中同样重要，能为队友提供稳定的先手机会。这类忍者的技能通常带有硬直、击飞或束缚效果，能有效限制对手行动。若队友选择高爆发忍者，控制型忍者可通过技能衔接延长对手受控时间，确保输出最大化。部分忍者还具备反手控制能力，能在被压制时迅速扭转局势。
生存能力较强的忍者适合在双人模式中担任辅助或持续输出的角色。这类忍者通常拥有位移、无敌帧或回复技能，能在战斗中保持较高的存活率。若队友选择脆皮高输出忍者，生存型忍者可承担更多承伤责任，并通过技能掩护队友。部分忍者还能通过技能组合形成持续压制，为队友创造输出空间。
